Ct(阈值循环)是扩增曲线与阈值线的交叉点(图 1B)。它是 PCR 反应中靶标浓度的相对测量。除靶标浓度之外,还有很多因素会影响 Ct 的***值。我们将要讨论最常见的可能影响 Ct 值的非模板依赖性因素,并描述如何评估实时荧光定量 PCR 反应的性能。
显示实时反应扩增图的几个参数,江苏MiRNA 荧光定量PCR分析服务。图 1B 中的**期对应于图 1C 中的线性期。阈值必须设在扩增图的线性期中。Ct 值随模板量减少而增加。然而,江苏MiRNA 荧光定量PCR分析服务,江苏MiRNA 荧光定量PCR分析服务,反应混合物或仪器中的任何干扰,只要能影响与 Ct 计算相关的荧光测定,都会使 Ct 值产生非模板依赖性的变化。因此,在不同条件下或用不同试剂进行的 PCR 反应产生的 Ct 值不可以直接进行比较。 江苏MiRNA 荧光定量PCR分析服务
所说的PCR应该就是**常规的PCR,以DNA为模板,通过上下游引物,实现DNA的扩增。
2、RT-PCR一般情况下是指反转录PCR(reverse transcription),尽管有些资料上说实时荧光定量PCR也(realtime fluores-cence quantitative PCR)也简称RT-PCR,但是这是不对的,不推荐。
基本操作过程是将所提取的RNA进行反转录,然后将所获得的cDNA作为模板,设计引物进行扩增,是一种检测基因表达的常用方法。
3、实时荧光定量PCR也就是Real-Time PCR,其比较大的作用是检测样品中的初始DNA浓度。
至于三者的关系,RT-PCR和实时定量PCR应该都属于PCR,在RNA实验中,这二者都会应用到 北京转基因荧光定量PCR实验技术服务
28S和18S核糖体RNA的带非常亮而浓(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),上面一条带的密度大约是下面一条带的2倍。还有可能观察到一个更小稍微扩散的带,它由低分子量的RNA(tRNA和5S核糖体RNA)组成。在18S和28S核糖体带之间可以看到一片弥散的EB染色物质,可能是由mRNA和其它异型RNA组成。RNA制备过程中如果出现DNA污染,将会在28S核糖体RNA带的上面出现,即更高分子量的弥散迁移物质或者带,RNA的降解表现为核糖体RNA带的弥散。用数码照相机拍下电泳结果。 ①反应体系 序号 反应物 剂量 1 逆转录buffer 2μl 2 上游引物 0.2μl 3 下游引物 0.2μl 4 dNTP 0.1μl 5 逆转录酶MMLV 0.5μl 6 DEPC水 5μl 7 RNA模版 2μl 8 总体积 10μl 轻弹管底将溶液混合,6000rpm短暂离心。
管家基因反应体系: 序号 反应物 剂量 1 SYBR Green 1 染料 10μl 2 内参照上游引物F 0.5μl 3 内参照下游引物R 0.5μl 4 dNTP 0.5μl 5 Taq酶 1μl 6 待测样品cDNA 5μl 7 ddH2O 32.5μl 8 总体积 50μl 轻弹管底将溶液混合,6000rpm短暂离心。
制备好的阳性标准品和检测样本同时上机,反应条件为:93℃2分钟,然后93℃ 1分钟,55℃ 2分钟,共40个循环。 针对每一需要测量的基因,选择一确定表达该基因的cDNA模板进行PCR反应。
反应体系: 序号 反应物 剂量 1 10×PCR缓冲液 2.5 ul 2 MgCl2溶液 1.5 ul 3 上游引物F 0.5 ul 4 下游引物R 0.5 ul 5 dNTP混合液 3 ul 6 Taq聚合酶 1 ul 7 cDNA 1 ul 8 加水至总体积为 25ul 轻弹管底将溶液混合,6000rpm短暂离心。
35个PCR循环(94℃1分钟;55℃1分钟;72℃1分钟); 72℃延伸5分钟。
PCR产物与 DNA Ladder在2%琼脂糖凝胶电泳,溴化乙锭染色,检测PCR产物是否为单一特异性扩增条带。
将PCR产物进行10倍梯度稀释: 设定PCR产物浓度为1×1010,依次稀释至109、108、107、106、105、104几个浓度梯度。 所有cDNA样品分别配置实时定量 PCR反应体系。
Rn 值是由 Applied Biosystems™ FAM™ 染料的荧光除以 ROX 染料的荧光而计算得出的比率。因此,假定 FAM 染料产生的荧光信号保持不变,ROX 染料量越少,产生的 Rn 值就越高。这将导致 Rn 基线上升,以及随后 ΔRn 的减少和 Ct 值的变化。通过降低 ROX 染料水平而得到不同 Ct 值,没有对反应的真实灵敏度产生任何影响,却有着意想不到的后果。如图 4 所示,降低 ROX 染料的浓度可能会增加 Ct 值的标准差。标准差越大,分辨靶浓度之间的细微区别的可信度就越低(参加下文的精确度一节)。上海DNA甲基化荧光定量PCR技术服务
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荧光信号**扩增阶段:只有在荧光产生进入**期, PCR产物量的对数值与起始模板量之间存在线性关系,所以在PCR反应处于**期的某一点上来检测PCR产物的量,由此来推断模板**初的含量而进行定量分析。研究表明,每个模板的Ct值与该模板的起始拷贝数的对数存在线性关系,起始拷贝数越多,Ct值越小。通过已知起始拷贝数的标准品可得到标准曲线,只要获得未知样品的Ct值,即可从标准曲线上计算出该样品的起始拷贝数
在平台期,扩增产物已不再呈**级的增加,所以反应终产物量与起始模板量之间已经不存在线性关系,通过反应终产物也算不出起始DNA拷贝数 江苏MiRNA 荧光定量PCR分析服务
上海朝瑞生物科技有限公司成立于2003-01-22,注册资本:700-1000万元。该公司服务型的公司。是一家有限责任公司企业,随着市场的发展和生产的需求,与多家企业合作研究,在原有产品的基础上经过不断改进,追求新型,在强化内部管理,完善结构调整的同时,优良的质量、合理的价格、完善的服务,在业界受到***好评。公司目前拥有***员工5~10人人,具有[ "科研技术服务", "应用技术服务", "科研成果转化", "科学产品销售" ]等多项业务。上海朝瑞科技将以真诚的服务、创新的理念、***的产品,为彼此赢得全新的未来!
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